Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms