Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcgP82348 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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