Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms