Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprn2P80560 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ptprn2P80560 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ptprn2P80560 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ptprn2P80560 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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