Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sycp3P70281 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms