Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb7P70195 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb7P70195 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb7P70195 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb7P70195 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb7P70195 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb7P70195 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb7P70195 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb7P70195 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb7P70195 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb7P70195 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb7P70195 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms