Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lrig1P70193 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms