Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Traf5P70191 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms