Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga11P61622 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms