Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms