Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ActbP60710 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ActbP60710 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ActbP60710 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms