Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl3P58873 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhbdl3P58873 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms