Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd4P58467 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Setd4P58467 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd4P58467 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms