Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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