Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TdgP56581 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TdgP56581 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TdgP56581 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TdgP56581 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TdgP56581 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TdgP56581 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TdgP56581 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TdgP56581 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TdgP56581 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TdgP56581 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TdgP56581 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms