Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lim2P56563 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lim2P56563 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lim2P56563 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lim2P56563 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Lim2P56563 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lim2P56563 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lim2P56563 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lim2P56563 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lim2P56563 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms