Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CartptP56388 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CartptP56388 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CartptP56388 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CartptP56388 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CartptP56388 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CartptP56388 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms