Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp1P56183 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms