Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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