Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GemP55041 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GemP55041 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GemP55041 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GemP55041 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms