Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cux1P53564 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms