Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TspoP50637 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TspoP50637 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TspoP50637 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TspoP50637 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TspoP50637 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TspoP50637 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms