Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpcP49452 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpcP49452 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms