Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb42P49222 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb42P49222 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms