Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc3P49135 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc3P49135 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc3P49135 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc3P49135 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc3P49135 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ercc3P49135 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ercc3P49135 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ercc3P49135 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ercc3P49135 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ercc3P49135 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ercc3P49135 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms