Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prox1P48437 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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