Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms