Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx1-2P42580 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms