Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Mmp9P41245 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mmp9P41245 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms