Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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