Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms