Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpardP35396 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpardP35396 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpardP35396 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpardP35396 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpardP35396 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpardP35396 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpardP35396 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpardP35396 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpardP35396 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpardP35396 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpardP35396 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PpardP35396 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms