Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms