Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp2P29594 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms