Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn10P28658 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms