Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Psmb9P28076 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms