Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BrafP28028 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BrafP28028 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BrafP28028 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BrafP28028 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BrafP28028 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BrafP28028 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BrafP28028 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BrafP28028 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BrafP28028 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BrafP28028 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BrafP28028 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BrafP28028 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms