Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgat1P27808 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mgat1P27808 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms