Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms