Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms