Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk11bP24788 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk11bP24788 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms