Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf239P24399 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms