Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd8P23463 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxd8P23463 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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