Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Ggta1P23336 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ggta1P23336 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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Ggta1P23336 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms