Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms