Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms