Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms