Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NelfeP19426 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NelfeP19426 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms