Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc1P19123 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms