Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18524 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18524 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18524 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18524 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms